گزارش گونه های نوکاردیای جداسازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن 16S rRNA، اصفهان، ایران
نویسندگان
چکیده مقاله:
مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیستهای هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتریهای ساکن خاک را شامل میشوند، که در جهان پخش شدهاند. در این مطالعه، با استفاده از آزمونهای تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزولههای نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد. مواد و روش ها: در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش Slip-buried و برای استخراج DNA، روش Microwave oven استفاده شد و در این روشها، سویه استاندارد DSM 43757 Nocardia asteroides استفاده شد. در ادامه، روش PCR با استفاده از پرایمرهای عمومی انجام شد. نتایج: با تحلیل اطلاعات فنوتیپی و مولکولی، بهویژه تعیین توالی ژن 16S rRNA، ژنهای نوکاردیایهای جداسازی شده از خاک اصفهان، که در ادامه به آنها اشاره شده است، درپایگاه داده NCBI باAccession number مربوط به هر ژن ثبت شدند. نوکاردیاهای ثبت شده در NCBI: Nocardia cyriacigeorgica KC577151, Nocardia asteroides KC577152, Nocardia cummidelens KC577153, Nocardia asteroides KC577155, Nocardia asteroides KC577155, Nocardia coubleae KC577156 .. بحث و نتیجه گیری: در این پژوهش 6 گونه نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد، که برخی از این گونه‌های جداسازی شده از خاک ایران، اصفهان، در زمان جداسازی و تشخیص،گونه‌های جدیدی بودند. برای تشخیص بیشترگونههای مختلف نوکاردیا میتوان در مطالعات بعدی از تکثیر و تعیین توالی ژنهای دیگر این باکتری از جمله ITS,hsp65 secA, rpoB و sod بهره گرفت.
منابع مشابه
گزارش گونه‌های نوکاردیای جداسازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن ۱۶s rrna، اصفهان، ایران
مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیستهای هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتریهای ساکن خاک را شامل میشوند، که در جهان پخش شدهاند. در این مطالعه، با استفاده از آزمونهای تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزولههای نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد. مواد و روشها: در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش slip-buried و برای استخراج dna، روش microwave oven استفاده شد و در این روشها، سویه...
متن کاملبررسی تنوع ژنتیکی جنسCrassostrea در سواحل بندر امام خمینی با روش تعیین توالی ژن 16S rRNA
16S rRNA یکی از اجزای بخش بزرگ ریبوزومی می باشد که بوسیله‌ی ژنوم میتوکندریایی کد می‌شود و به طور گسترده‌ای در مطالعات فیلوژنتیکی مربوط به گونه‌های نزدیک و به خصوص گونه های مربوط به Crassostrea مورد استفاده قرار می‌گیرد. پلی مورفیسم توالی نوکلئوتیدی مربوط به ژن 16S rRNA ژنوم میتوکندریایی اویستر خلیج فارس (Crassostrea sp.)، در 30 نمونه اویستر جمع آوری شده از بندر امام خمینی مورد بررسی قرار گرفت. ...
متن کاملجداسازی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس تولید کننده لیزواستافین، از ورم پستان گاوی و شناسایی آن بر اساس تعیین توالی 16S rRNA
سابقه و هدف: استافیلوکوکوس سیمولانس یک کوکسی گرم مثبت و خوشه ای می باشد که از پوست، ادرار و نمونه های بالینی انسان و حیوان به ویژه عفونت پستان گاوی جداسازی شده است. این پژوهش با هدف جداسازی و شناسایی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس تولید کننده لیزواستافین، از ورم پستان گاوی و نیز معرفی آن به عنوان یک عامل درمانی جدید در درمان عفونت های استافیلوکوکی انجام شده است. مواد و روش ها: این پژوهش به صور...
متن کاملجداسازی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس تولید کننده لیزواستافین، از ورم پستان گاوی و شناسایی آن بر اساس تعیین توالی 16S rRNA
سابقه و هدف: استافیلوکوکوس سیمولانس یک کوکسی گرم مثبت و خوشه ای می باشد که از پوست، ادرار و نمونه های بالینی انسان و حیوان به ویژه عفونت پستان گاوی جداسازی شده است. این پژوهش با هدف جداسازی و شناسایی باکتری استافیلوکوکوس سیمولانس تولید کننده لیزواستافین، از ورم پستان گاوی و نیز معرفی آن به عنوان یک عامل درمانی جدید در درمان عفونت های استافیلوکوکی انجام شده است. مواد و روش ها: این پژوهش به صور...
متن کاملتنوع ژنتیکی میگوی سرتیز Metapenaeus affinis در خلیج فارس بر اساس توالی ژن میتوکندریایی 16S rRNA
میگوی سرتیز رتبه دوم میزان صید میگوی را در استان هرمزگان داشته و در چرخه صید و صیادی خلیج فارس اهمیت زیادی دارد. از این رو، بررسی تنوع ژنتیکی این گونه مهم مد نظر قرار گرفت. نمونه‌های میگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و آبادان جمع‌آوری شدند و برای توالی‌یابی ژن میتوکندریایی 16S rRNA مورد بررسی قرار گرفتند. بهینه‌سازی واکنش PCR جهت تکثیر ژن انجام شد. نتایج توالی‌یابی ژن 16S rRNA که شامل 486 باز هم...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 4 شماره 16
صفحات 33- 42
تاریخ انتشار 2016-02-20
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023